Das ehemalige Augustiner-Chorherren-Stift Baumburg wurde im Zuge der Säkularisation im Jahr 1803 aufgelöst. Heute ist Baumburg ein katholisches Dekanat, das die Pfarrgemeinden des nördlichen Chiemgaus umfasst. Die Stiftskirche dient als Pfarrkirche von Altenmarkt. Einige Gebäude des Klosters wurden abgerissen, einige sind in Privatbesitz, wie die 1612 gegründete Klosterbrauerei Baumburg, deren Klosterstüberl zur einkehr einlädt.
Durch das Klostergelände verläuft übrigens der 48. Breitengrad.